V AG 101 (101. leto koledarja napredne generacije) skrivnostna entiteta, znana le pod imenom "UE" ali "neznani sovražnik", napada in uničuje vesoljsko kolonijo Angel. Ta brutalni napad postane znan kot "Dan, ko je padel angel" in pomeni začetek človeške vojne za preživetje. Serija se začne v AG 108, ko UE napade vesoljsko kolonijo Ovan, kjer Flit Asuno zdaj živi, potem ko je pobegnil iz kolonije Angel pred njenim uničenjem. Mati Flit, tik preden jo uniči UE, sinu podari predmet, imenovan "AGE Device". V njem odkrije načrte za močno orožje iz preteklosti - starodavnega mesijo z imenom "Gundam".
Na podlagi teh načrtov Flit naslednjih nekaj let študira inženirstvo v bazi Zemeljske zveze v vesoljski koloniji Nora in oblikuje Gundam AGE-1. Sedem let kasneje, v AG 115, Flit dokonča Gundam AGE-1 Normal, tako kot je UE napadel Noro, in ga uporabi za pomoč posadki federacijske bojne ladje "Diva" pri evakuaciji državljanov kolonije, preden je uničena. Flit, ki je odločen, da bo UE začel bitko zaradi dvakratnega uničenja njegovega doma, se strinja, da bo služil pri Divini mobilni ekipi, ki pilotira Gundam. Potem ko je posadka Dive in njunih zaveznikov pridobila dovolj podatkov in vojaške moči, da bi oblikovala potek akcije, je uspešno začela napad, ki je uničil skrivno utrdbo UE v asteroidu Ambat. Tam izvedo, da so UE dejansko potomci domnevno propadle človeške misije, poslane v kolonizacijo Marsa, ki ga je Zemljina zveza pustila mrtvim, ki so na rdečem planetu Veigan oblikovali svoj narod.
